20 Desember 2021
Omicron sejauh ini merupakan varian COVID-19 yang bermutasi paling kuat hingga saat ini, dan berada di jalur untuk melengserkan delta sebagai strain dominan.
Sejak strain pertama kali terdeteksi di Korea pada 1 Desember, varian tersebut telah ditemukan di lebih dari 160 kasus di sini. Dari jumlah tersebut, 39 memiliki riwayat perjalanan baru-baru ini dan sisanya adalah kontak dekat atau tidak langsung. Penularan komunitas, kata otoritas kesehatan masyarakat, kemungkinan besar sudah berlangsung.
Untuk memahami implikasi dari varian terbaru, untuk mulai memahami sepenuhnya kemampuannya, penting untuk terlebih dahulu memahami peran yang dimainkan oleh protein puncak SARS-CoV-2, virus penyebab COVID-19, selama sebuah infeksi.
Bagaimana virus corona menginfeksi sel
Protein puncak terdiri dari dua subunit, S1 dan S2. Ujung luar paku, S1, termasuk domain pengikat reseptor, atau RBD, yang berikatan dengan reseptor ACE2 sel manusia. Setelah mengikat, S2 bertanggung jawab untuk memediasi fusi virus dengan sel.
Omicron memiliki banyak mutasi di bagian RBD S1 yang tampaknya memberi virus afinitas yang lebih tinggi untuk ACE2. Ini juga memiliki mutasi di dekat situs pembelahan furin S2, di mana enzim yang disebut furin memotong lonjakan dan menyebabkan fusi sel virus. Mutasi di sekitar situs ini dapat membuat penyambungan menjadi lebih efisien dan, akibatnya, meningkatkan penularan virus.
Apa yang bisa diberitahukan oleh mutasi omicron kepada kita
dr. Paik Soon-young, seorang profesor emeritus mikrobiologi di Universitas Katolik Korea, mengatakan bahwa omicron memiliki fitur yang membuatnya lebih mudah menular dan menghindari kekebalan. Namun sisi baiknya, varian terbaru yang menjadi perhatian sepertinya akan lebih ringan, ujarnya.
Tidak setiap mutasi yang terlihat di omicron relevan atau mengkhawatirkan, katanya. Tetapi kenaikan omicron telah menimbulkan kekhawatiran karena banyaknya perubahan pada protein puncaknya – 36 kekalahan, menurut sampel awal. Lokasi mutasi pada paku dapat memberikan beberapa petunjuk tentang seberapa besar risiko yang mungkin ditimbulkannya, katanya.
Sekitar dua pertiga dari lebih dari 30 mutasi protein puncak yang ditemukan di omicron dibagi dengan varian utama lainnya yang telah terbukti lebih menular dan mengelak dari vaksin dan antibodi monoklonal, katanya.
Di Afrika Selatan, di mana varian baru pertama kali terdeteksi, kasus meningkat pesat, menyalip varian sebelumnya. Di luar Afrika Selatan, itu telah menggantikan delta di London dan berada di jalur yang tepat untuk menjadi dominan di seluruh Eropa dan AS sekitar bulan Januari, menurut perkiraan oleh badan kesehatan di sana.
Terlepas dari lonjakannya yang sangat berubah, omicron juga memiliki mutasi pada protein non-struktural yang bertanggung jawab untuk replikasi virus. Mutasi ini tampaknya telah merusak protein nonstruktural agar tidak berfungsi dengan baik, dan dengan demikian dapat melemahkan kemampuan virus untuk menyebabkan penyakit parah.
Laporan awal dari Afrika Selatan mengaitkan omikron dengan penyakit ringan, katanya. Satu studi mengatakan risiko rawat inap di antara orang dewasa adalah 29 persen lebih rendah dengan omicron daripada virus aslinya – sambil mencatat bahwa ini mungkin dipengaruhi oleh fakta bahwa mayoritas penduduk Afrika Selatan sebelumnya pernah terpapar COVID-19.
Data Korea masih langka, tetapi tidak ada pasien dengan infeksi omicron yang dikonfirmasi atau diduga menjadi cukup sakit untuk dirawat di rumah sakit, dan hanya mengalami gejala minimal hingga ringan, menurut data resmi.
Meski begitu, Paik mengatakan aturan yang sama – kebersihan pribadi, menghindari keramaian dan memakai masker – tetap penting untuk mencegah omicron. Bahkan jika virus itu sendiri kurang ganas, jika sejumlah besar orang terinfeksi, ini akan menyebabkan peningkatan rawat inap dan kematian yang sesuai.
Dia menambahkan bahwa tidak mudah untuk memprediksi bagaimana varian berperilaku hanya dengan menggunakan profil mutasinya. Varian mengkhawatirkan lainnya yang datang sebelumnya, seperti delta plus, gagal menyebar sejauh yang dikhawatirkan. Ada interaksi variabel yang kompleks seperti tingkat vaksinasi dan perilaku kolektif kita yang dapat memengaruhi perjalanan virus.
Jadi bagaimana omicron berakhir dengan lebih dari 50 mutasi?
Omicron telah mengumpulkan banyak mutasi dari varian sebelumnya, ujarnya. Hal ini dapat dijelaskan dengan apa yang dikenal sebagai rekombinasi, di mana dua galur bertukar fragmen materi genetik selama peristiwa koinfeksi – walaupun mungkin juga dapat mengembangkan mutasi ini secara mandiri.
Lanskap varian saat ini di Korea sebagian besar adalah delta dan sangat sedikit omikron. Dia mengatakan bahwa, misalnya, selama proses bersaing untuk mendapatkan dominasi, kedua varian tersebut secara teori dapat melebur dan menghasilkan varian rekombinan lainnya.
“Varian tidak semuanya berita buruk,” katanya. “Naluri virus bukanlah untuk membunuh, tetapi untuk berkeliaran di sekitar kita selama mungkin. Jadi jika omicron memang tidak terlalu parah, dan terus menyalip delta, itu bisa meningkatkan peluang kita melawan pandemi. Sekali lagi terlalu dini untuk mengatakannya.”
Beberapa kelegaan diharapkan saat pil antivirus baru tiba, yang diharapkan menjadi “pasangan yang lebih baik tidak hanya untuk omicron, tetapi varian secara umum daripada antibodi monoklonal,” katanya.
Antibodi monoklonal, yang dikembangkan untuk mencegah masuknya virus dengan menargetkan reseptor spesifik, mungkin tidak mengenali potongan protein lonjakan virus yang bermutasi. Pil, di sisi lain, dirancang untuk menghambat replikasi virus setelah infeksi berlangsung.
Meski ringan, itu datang pada waktu yang buruk
dr. Jerome Kim, direktur jenderal Institut Vaksin Internasional, mengatakan: “Meskipun mungkin tidak terlalu parah atau dikurangi dengan vaksinasi, fakta bahwa mikron jauh lebih mudah menular berarti jumlah absolut rawat inap dapat meningkat.”
Rumah sakit dan ICU Korea sudah menderita akibat wabah yang sedang berlangsung. “Jika itu menambah bahkan 10 persen di atas tekanan ‘terkait delta’ saat ini pada perawatan kesehatan – di mana kita akan berada?”
Kim mengatakan beberapa pelajaran yang bisa diambil dari lonjakan terbaru adalah pengingat bahwa antibodi yang diinduksi vaksin terhadap penyakit menurun seiring waktu. “Lansia mungkin seharusnya mendapat dorongan lebih awal dan pesan tentang risiko seharusnya mengiringi pelonggaran pembatasan lebih intensif,” katanya.
“Omicron, dengan mutasinya dan hilangnya perlindungan yang terlihat dari waktu ke waktu, adalah salah satu varian yang harus kita perhatikan dan tingkatkan,” katanya.
Mutasi pada protein puncak, yang diarahkan oleh banyak respons perlindungan yang diinduksi oleh vaksin, menjadikan omicron “target yang lebih sulit tidak hanya untuk vaksin tetapi juga untuk beberapa antibodi monoklonal terapeutik,” katanya. Dibandingkan dengan delta, dengan omicron, dapat terjadi penurunan 30 hingga 40 kali lipat dalam tingkat perlindungan yang diukur dengan antibodi penawar.
“Bahkan dengan seri primer vaksin mRNA dua dosis, data awal dari studi tabung reaksi dari beberapa kelompok menunjukkan bahwa kecuali tingkat antibodi pelindung dapat ditingkatkan — yaitu, ditingkatkan — banyak, jika tidak sebagian besar, sampel yang diuji mungkin akan hilang. potensi untuk ‘menetralisir’ COVID-19.
Meskipun omicron dapat melemahkan antibodi penawar yang berasal dari vaksin, komponen lain dari sistem kekebalan yang dikenal sebagai sel T masih dapat mengenali varian baru dan membatasi perkembangan menjadi COVID-19 yang parah.
Sebuah artikel yang ditulis bersama Kim, diterbitkan 8 September di Nature, mengatakan bahwa dibandingkan dengan antibodi penawar, sel T memori spesifik COVID-19 “dipertahankan untuk waktu yang relatif lama.”
“Ada semakin banyak bukti bahwa varian yang menjadi perhatian jarang lolos dari respons sel-T memori yang disebabkan oleh infeksi atau vaksinasi,” bunyinya.
Dalam persiapan distribusi omicron, dia mengatakan bahwa otoritas kesehatan masyarakat harus memantau kapasitas ICU dan departemen isolasi serta mempersiapkan kemungkinan pembatasan layanan medis hanya untuk layanan esensial. Pembatasan yang diperkuat pada pertemuan, penguatan jarak, dan keselamatan di tempat kerja adalah beberapa taktik yang harus dipertimbangkan.
Juga harus ada tinjauan yang dipercepat dari pengobatan antibodi monoklonal yang digunakan di sini dan kemampuannya untuk menetralkan omicron sementara persetujuan darurat untuk terapi antivirus dan antibodi diperoleh dan dievaluasi.
“Saya menganggap pemerintah sudah melakukan semua ini,” tambahnya.
Mengenai prospek vaksin yang diperbarui, dia mengatakan saat ini belum banyak informasi yang tersedia tentang apakah vaksin baru tersebut akan mampu menghasilkan tingkat perlindungan yang lebih tinggi daripada vaksin mRNA.
“Data dari vaksin baru yang sudah selesai pengujian dan sedang menunggu persetujuan WHO – Novavax, Clover, Zhifei – atau masih dalam pengujian – Sanofi, SK biosciences, dll – masih pending,” katanya. Tetapi jika kita membutuhkannya, sebagian besar perusahaan harus dapat mengembangkan, menguji, dan mendapatkan persetujuan untuk varian vaksin “dalam waktu kurang dari separuh waktu yang dibutuhkan semula”.
Dia menambahkan bahwa omicron memberi lebih banyak alasan untuk mendorong orang tua memvaksinasi anak-anak mereka sekarang, mengutip laporan dari Afrika Selatan bahwa itu mungkin lebih serius pada anak-anak.
“Meskipun omicron belum besar di sini, itu akan terjadi. Dan ketika saatnya tiba, jika kita tidak mau melangkah dan memvaksinasi anak usia sekolah kita, kita akan menempatkan diri kita sendiri dan orang lain dalam risiko yang lebih besar,” katanya.
“Kami tidak dapat memprediksi kapan delta berikutnya, atau omicron berikutnya akan datang. Sampai kita memiliki vaksin yang lebih baik yang bertahan lebih lama, menawarkan perlindungan yang lebih luas terhadap beragam varian, atau memblokir penularan secara lebih efektif, kita harus waspada.”
dr. Paik Soon-young, profesor mikrobiologi emeritus di Catholic University of Korea (kiri); dr. Jerome Kim, direktur jenderal Institut Vaksin Internasional (Park Hyun-koo/The Korea Herald)